Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH16O75309 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH16O75309 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH16O75309 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH16O75309 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH16O75309 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH16O75309 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH16O75309 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH16O75309 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH16O75309 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH16O75309 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH16O75309 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH16O75309 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH16O75309 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH16O75309 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH16O75309 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH16O75309 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH16O75309 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH16O75309 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH16O75309 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH16O75309 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH16O75309 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH16O75309 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH16O75309 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH16O75309 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH16O75309 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH16O75309 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH16O75309 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH16O75309 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH16O75309 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH16O75309 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH16O75309 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH16O75309 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH16O75309 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH16O75309 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH16O75309 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH16O75309 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH16O75309 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH16O75309 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH16O75309 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH16O75309 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH16O75309 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH16O75309 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH16O75309 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH16O75309 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH16O75309 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH16O75309 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH16O75309 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH16O75309 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH16O75309 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH16O75309 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH16O75309 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH16O75309 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH16O75309 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH16O75309 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH16O75309 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH16O75309 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH16O75309 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH16O75309 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH16O75309 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH16O75309 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH16O75309 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH16O75309 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH16O75309 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH16O75309 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH16O75309 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH16O75309 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH16O75309 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH16O75309 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH16O75309 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH16O75309 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH16O75309 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH16O75309 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH16O75309 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH16O75309 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH16O75309 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms