Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TIMM17BO60830 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms