Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSCO60682 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MSCO60682 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MSCO60682 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSCO60682 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSCO60682 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSCO60682 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSCO60682 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MSCO60682 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSCO60682 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MSCO60682 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSCO60682 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSCO60682 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSCO60682 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSCO60682 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSCO60682 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSCO60682 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSCO60682 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSCO60682 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSCO60682 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSCO60682 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MSCO60682 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSCO60682 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MSCO60682 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSCO60682 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSCO60682 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSCO60682 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSCO60682 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSCO60682 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSCO60682 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSCO60682 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSCO60682 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MSCO60682 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSCO60682 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSCO60682 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MSCO60682 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSCO60682 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MSCO60682 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSCO60682 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSCO60682 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSCO60682 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSCO60682 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSCO60682 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSCO60682 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSCO60682 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MSCO60682 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MSCO60682 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSCO60682 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSCO60682 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSCO60682 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSCO60682 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSCO60682 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSCO60682 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSCO60682 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSCO60682 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSCO60682 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSCO60682 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSCO60682 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSCO60682 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSCO60682 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSCO60682 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSCO60682 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSCO60682 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSCO60682 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSCO60682 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSCO60682 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSCO60682 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSCO60682 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSCO60682 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSCO60682 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSCO60682 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSCO60682 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSCO60682 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSCO60682 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSCO60682 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSCO60682 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSCO60682 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSCO60682 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSCO60682 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSCO60682 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MSCO60682 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSCO60682 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSCO60682 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms