Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
KIAA0556O60303 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
KIAA0556O60303 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms