Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKAB2O43741 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKAB2O43741 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms