Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELR3O43731 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELR3O43731 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms