Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHMP2AO43633 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP2AO43633 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms