Protein–RNA interactions for Protein: O43491

EPB41L2, Band 4.1-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L2O43491 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPB41L2O43491 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPB41L2O43491 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPB41L2O43491 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EPB41L2O43491 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPB41L2O43491 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms