Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNN4O15554 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNN4O15554 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms