Protein–RNA interactions for Protein: O15119

TBX3, T-box transcription factor TBX3, humanhuman

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX3O15119 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBX3O15119 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBX3O15119 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBX3O15119 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TBX3O15119 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBX3O15119 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBX3O15119 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBX3O15119 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBX3O15119 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBX3O15119 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBX3O15119 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TBX3O15119 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBX3O15119 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBX3O15119 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBX3O15119 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBX3O15119 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBX3O15119 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBX3O15119 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBX3O15119 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBX3O15119 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBX3O15119 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBX3O15119 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBX3O15119 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TBX3O15119 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBX3O15119 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBX3O15119 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBX3O15119 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBX3O15119 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBX3O15119 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBX3O15119 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBX3O15119 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBX3O15119 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBX3O15119 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBX3O15119 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBX3O15119 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBX3O15119 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBX3O15119 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBX3O15119 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBX3O15119 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBX3O15119 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBX3O15119 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBX3O15119 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBX3O15119 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBX3O15119 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBX3O15119 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBX3O15119 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBX3O15119 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBX3O15119 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TBX3O15119 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBX3O15119 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TBX3O15119 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBX3O15119 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX3O15119 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX3O15119 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX3O15119 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX3O15119 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX3O15119 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX3O15119 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX3O15119 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX3O15119 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX3O15119 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX3O15119 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX3O15119 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX3O15119 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBX3O15119 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TBX3O15119 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TBX3O15119 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TBX3O15119 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TBX3O15119 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TBX3O15119 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TBX3O15119 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TBX3O15119 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TBX3O15119 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TBX3O15119 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TBX3O15119 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TBX3O15119 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TBX3O15119 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TBX3O15119 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TBX3O15119 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TBX3O15119 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TBX3O15119 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TBX3O15119 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TBX3O15119 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TBX3O15119 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TBX3O15119 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TBX3O15119 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX3O15119 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX3O15119 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX3O15119 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX3O15119 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX3O15119 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBX3O15119 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX3O15119 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX3O15119 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX3O15119 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX3O15119 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX3O15119 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX3O15119 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX3O15119 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBX3O15119 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms