Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
KDM6BO15054 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM6BO15054 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM6BO15054 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms