Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL22O00626 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL22O00626 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL22O00626 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL22O00626 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL22O00626 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL22O00626 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL22O00626 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL22O00626 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL22O00626 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL22O00626 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL22O00626 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL22O00626 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL22O00626 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL22O00626 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL22O00626 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL22O00626 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL22O00626 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL22O00626 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL22O00626 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL22O00626 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL22O00626 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL22O00626 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL22O00626 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL22O00626 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL22O00626 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL22O00626 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCL22O00626 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL22O00626 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL22O00626 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL22O00626 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL22O00626 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL22O00626 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL22O00626 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL22O00626 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL22O00626 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL22O00626 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL22O00626 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCL22O00626 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCL22O00626 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL22O00626 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL22O00626 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL22O00626 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL22O00626 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL22O00626 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL22O00626 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL22O00626 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL22O00626 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL22O00626 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL22O00626 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL22O00626 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL22O00626 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL22O00626 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL22O00626 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL22O00626 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL22O00626 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL22O00626 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL22O00626 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL22O00626 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL22O00626 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL22O00626 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL22O00626 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL22O00626 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL22O00626 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL22O00626 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL22O00626 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL22O00626 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL22O00626 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL22O00626 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL22O00626 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL22O00626 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL22O00626 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL22O00626 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL22O00626 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL22O00626 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL22O00626 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL22O00626 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL22O00626 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL22O00626 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL22O00626 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms