Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GFRA2O00451 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms