Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIP1O00291 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIP1O00291 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIP1O00291 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIP1O00291 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIP1O00291 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIP1O00291 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIP1O00291 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIP1O00291 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIP1O00291 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIP1O00291 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIP1O00291 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIP1O00291 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIP1O00291 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIP1O00291 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIP1O00291 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIP1O00291 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIP1O00291 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIP1O00291 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIP1O00291 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIP1O00291 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIP1O00291 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIP1O00291 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HIP1O00291 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIP1O00291 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIP1O00291 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIP1O00291 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIP1O00291 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIP1O00291 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIP1O00291 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIP1O00291 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HIP1O00291 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIP1O00291 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIP1O00291 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIP1O00291 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIP1O00291 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIP1O00291 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HIP1O00291 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIP1O00291 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIP1O00291 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIP1O00291 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIP1O00291 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIP1O00291 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIP1O00291 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIP1O00291 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIP1O00291 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIP1O00291 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIP1O00291 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HIP1O00291 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIP1O00291 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIP1O00291 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIP1O00291 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIP1O00291 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIP1O00291 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIP1O00291 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIP1O00291 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIP1O00291 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIP1O00291 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIP1O00291 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIP1O00291 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIP1O00291 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIP1O00291 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIP1O00291 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HIP1O00291 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIP1O00291 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIP1O00291 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIP1O00291 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIP1O00291 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIP1O00291 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIP1O00291 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIP1O00291 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HIP1O00291 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIP1O00291 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIP1O00291 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIP1O00291 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIP1O00291 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIP1O00291 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HIP1O00291 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIP1O00291 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIP1O00291 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIP1O00291 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIP1O00291 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIP1O00291 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIP1O00291 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms