Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF10AO00220 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF10AO00220 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF10AO00220 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms