Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
I3L3M4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
I3L3M4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
I3L3M4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
I3L3M4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
I3L3M4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
I3L3M4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
I3L3M4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
I3L3M4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
I3L3M4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
I3L3M4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
I3L3M4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
I3L3M4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
I3L3M4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
I3L3M4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
I3L3M4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
I3L3M4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
I3L3M4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
I3L3M4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
I3L3M4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
I3L3M4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
I3L3M4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
I3L3M4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
I3L3M4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
I3L3M4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
I3L3M4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
I3L3M4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
I3L3M4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
I3L3M4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
I3L3M4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
I3L3M4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
I3L3M4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
I3L3M4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
I3L3M4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
I3L3M4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
I3L3M4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
I3L3M4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
I3L3M4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
I3L3M4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
I3L3M4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
I3L3M4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
I3L3M4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
I3L3M4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
I3L3M4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
I3L3M4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
I3L3M4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
I3L3M4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
I3L3M4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
I3L3M4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
I3L3M4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
I3L3M4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
I3L3M4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
I3L3M4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
I3L3M4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
I3L3M4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
I3L3M4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
I3L3M4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
I3L3M4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
I3L3M4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
I3L3M4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
I3L3M4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
I3L3M4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
I3L3M4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
I3L3M4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms