Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMKR1H3BMG3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms