Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PBE3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PBE3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PBE3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PBE3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PBE3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PBE3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PBE3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PBE3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PBE3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PBE3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PBE3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PBE3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PBE3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PBE3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PBE3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PBE3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PBE3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PBE3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PBE3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PBE3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PBE3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PBE3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PBE3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PBE3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PBE3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PBE3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PBE3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PBE3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PBE3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PBE3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PBE3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PBE3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PBE3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PBE3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PBE3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PBE3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PBE3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PBE3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E9PBE3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E9PBE3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E9PBE3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PBE3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PBE3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PBE3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PBE3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PBE3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PBE3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PBE3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PBE3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PBE3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PBE3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PBE3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PBE3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PBE3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PBE3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PBE3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PBE3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PBE3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PBE3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PBE3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PBE3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PBE3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PBE3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PBE3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PBE3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PBE3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PBE3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PBE3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PBE3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PBE3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PBE3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PBE3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PBE3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PBE3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PBE3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PBE3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PBE3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PBE3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PBE3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PBE3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PBE3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PBE3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PBE3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PBE3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms