Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L13C9JLJ4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L13C9JLJ4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms