Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVV-2B6SEH9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms