Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL13PA6NNM8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL13PA6NNM8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms