Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRRM3A6NNA2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRRM3A6NNA2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms