Protein–RNA interactions for Protein: A6NCK2

TRIM43B, Tripartite motif-containing protein 43B, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43BA6NCK2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43BA6NCK2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM43BA6NCK2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43BA6NCK2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms