Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms