Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCHNA4D1U4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LCHNA4D1U4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCHNA4D1U4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms