Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA8A3KMH1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA8A3KMH1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms