Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQS6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQS6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQS6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQS6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQS6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQS6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQS6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQS6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQS6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQS6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQS6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQS6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQS6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQS6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms