Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQJ8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms