Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 FAM170A-206ENST00000613773 1374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AL157838.1-201ENST00000424252 2502 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 MPP4-208ENST00000447335 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 DCAKD-202ENST00000342350 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 DCAKD-203ENST00000452796 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC100793.3-201ENST00000592440 719 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC011458.2-201ENST00000603937 207 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 CLEC17A-203ENST00000547437 2065 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 RDH16-202ENST00000398138 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 POM121L1P-202ENST00000605258 1835 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 SMUG1-AS1-201ENST00000634796 1734 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 THEMIS3P-201ENST00000416112 1586 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 TMUB2-203ENST00000446571 1580 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 SLC25A19-210ENST00000580994 1554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 HNRNPA1P8-201ENST00000436090 951 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 SUOX-203ENST00000394109 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 STRADA-253ENST00000640979 2086 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 HSPBAP1-201ENST00000306103 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO3Q8TAP4 IL21R-202ENST00000395754 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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