Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 RBMXP2-201ENST00000434705 1168 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 LOXHD1-204ENST00000398705 1824 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 METTL3-201ENST00000298717 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMPOP42166 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 PCLAF-201ENST00000300035 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMPOP42166 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMPOP42166 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMPOP42166 TRIM31-210ENST00000376734 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMPOP42166 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMPOP42166 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 FMR1-220ENST00000621987 1352 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 IGHV3-74-201ENST00000424969 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 AL391832.3-201ENST00000549744 846 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 CYLD-214ENST00000569418 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMPOP42166 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms