Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 NANP-201ENST00000304788 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 GIMAP1-GIMAP5-201ENST00000611999 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 NEK1-201ENST00000439128 5653 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PRDM11-204ENST00000530656 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ALPL-203ENST00000374832 2193 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CMTR2-202ENST00000434935 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC020915.2-201ENST00000591325 4227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 BDNF-215ENST00000530861 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 MARCH8-204ENST00000453424 5638 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 FAM131A-211ENST00000639617 4450 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ZWILCH-209ENST00000565627 1845 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 IFNAR2-205ENST00000404220 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ABCB4-201ENST00000265723 4020 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 595.1 ms