Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SPRY2-202ENST00000377104 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PMEL-201ENST00000449260 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC104435.2-201ENST00000478745 866 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 COL9A1-202ENST00000357250 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 HSPBAP1-201ENST00000306103 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ACOX3-201ENST00000356406 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TBCEL-202ENST00000422003 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AGAP6-203ENST00000618025 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PPT1-219ENST00000642050 4010 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC21-201ENST00000380916 9160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 DRC1-201ENST00000288710 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 GOLGA2P1-201ENST00000512938 2906 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 EME1-207ENST00000511648 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FER1L4-208ENST00000611673 3860 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC10-209ENST00000525998 1841 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 GRAMD1B-203ENST00000456860 2805 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SCN4B-201ENST00000324727 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MKNK2-213ENST00000591601 3582 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS20-202ENST00000395541 4633 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 GPR132-201ENST00000329797 3660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CTLA4-202ENST00000302823 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TAS1R2-201ENST00000375371 2542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 VPS39-201ENST00000318006 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AP000894.1-201ENST00000584430 520 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC026369.1-202ENST00000508953 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CDK14-202ENST00000380050 4995 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ZMYND11-201ENST00000309776 4228 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC068775.1-201ENST00000322446 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 GRHL3-201ENST00000236255 1870 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TUBB8-204ENST00000564130 2438 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CCDC144A-206ENST00000399273 8686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PLAGL2-201ENST00000246229 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 HPGD-214ENST00000542498 2786 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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