Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ENO4-203ENST00000409522 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 IQCD-202ENST00000416617 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 COQ5-201ENST00000288532 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 LMCD1-202ENST00000397386 1501 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SCN8A-215ENST00000638820 3359 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 TBC1D3P3-201ENST00000342824 1080 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC026202.1-201ENST00000443087 585 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 RPSAP5-201ENST00000485258 884 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC010442.2-201ENST00000509301 407 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MIR4296-201ENST00000581038 88 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 GOLGA8Q-201ENST00000562783 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 CFAP157-202ENST00000373295 1721 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 IGF2BP1-202ENST00000431824 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 LEMD2-207ENST00000508327 1306 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PDPN-210ENST00000513143 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 NR1I2-207ENST00000640105 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 COX6B2-209ENST00000590900 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC004951.1-201ENST00000447643 1866 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 NDUFAF3-201ENST00000326912 705 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 LINC00106-201ENST00000430235 370 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 LINC01524-202ENST00000454600 745 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 RN7SL225P-201ENST00000464648 298 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AP001266.1-201ENST00000531155 1044 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AP002383.2-201ENST00000545768 675 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MIR3177-201ENST00000578255 82 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SH3GL1P2-201ENST00000582245 1082 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AFMID-205ENST00000586731 550 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AFMID-210ENST00000589256 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC099804.1-201ENST00000623105 714 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PTAFR-201ENST00000305392 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 SERINC3-201ENST00000255175 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms