Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AL139353.1-202ENST00000547378 474 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 MYT1-202ENST00000360149 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMPOP42166 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ALPL-203ENST00000374832 2193 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AP003063.2-201ENST00000525984 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 HEBP1-203ENST00000536942 2056 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 KRT18P39-201ENST00000415349 1299 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 WTAPP1-202ENST00000525739 2642 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMPOP42166 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SPO11-201ENST00000345868 1666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC073488.1-201ENST00000416620 1600 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 TSGA10-201ENST00000355053 3037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 FAM86FP-202ENST00000427893 829 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms