Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms