Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSC4Q9Y5U2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSC4Q9Y5U2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSC4Q9Y5U2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSC4Q9Y5U2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSSC4Q9Y5U2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms