Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
DCAF1Q9Y4B6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC42.93■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC42.92■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC42.88■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.46
DCAF1Q9Y4B6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC42.87■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC42.87■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC42.83■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
DCAF1Q9Y4B6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
DCAF1Q9Y4B6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms