Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF330Q9Y3S2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF330Q9Y3S2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF330Q9Y3S2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms