Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REXO2Q9Y3B8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REXO2Q9Y3B8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms