Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP3Q9Y2W7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms