Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
THRAP3Q9Y2W1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
THRAP3Q9Y2W1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THRAP3Q9Y2W1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms