Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG6Q9Y2V7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG6Q9Y2V7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms