Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YBX2Q9Y2T7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms