Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms