Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
L1RE1Q9UN81 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms