Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FZD4Q9ULV1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms