Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRPF3Q9ULD4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms