Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB23Q9ULC3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB23Q9ULC3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.4 ms