Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS11EQ9UL52 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMPRSS11EQ9UL52 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS11EQ9UL52 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11EQ9UL52 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms