Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP4Q9UKK3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms